Angka kejadian kanker pada anak-anak dengan esofagus Barrett umumnya kurang dari 1% dan sebagian besar pasien tidak berkembang menjadi kanker, meskipun waktu yang dibutuhkan untuk berkembangnya kanker sangat bervariasi, dan bisa bertahun-tahun atau puluhan tahun. Esofagus Barrett biasanya terlihat pada pasien dengan refluks gastro-esofagus, di mana rangsangan oleh asam lambung dan zat-zat lain di dalam perut dapat menyebabkan epitel skuamosa mukosa esofagus yang normal digantikan oleh epitel kolumnar, yang sering disertai dengan metaplasia epitel usus. Metaplasia epitel usus dengan hiperplasia atipikal memiliki risiko terjadinya neoplasia bersamaan, tetapi risikonya umumnya rendah. Gastroskopi biasanya diulang secara teratur di samping terapi obat. Untuk pasien tanpa hiperplasia atipikal, gastroskopi harus diulang setiap 1-2 tahun; untuk hiperplasia atipikal ringan, pemeriksaan ulang setidaknya setahun sekali dianjurkan; untuk hiperplasia atipikal yang parah, pemeriksaan ulang setiap 6 bulan sekali mungkin diperlukan dan debridemen mukosa endoskopik, laser, elektrokoagulasi, atau bahkan intervensi bedah dapat dipertimbangkan. Pasien dengan esofagus Barrett tidak perlu terlalu khawatir. Dengan pemeriksaan rutin, pengobatan teratur, gaya hidup yang lebih baik, serta deteksi dini dan pengobatan, sebagian besar pasien tidak akan berkembang menjadi kanker.