Siklofosfamid (CTX) berguna dalam pengobatan penyakit jaringan ikat seperti lupus nefritis dan vaskulitis sistemik, tetapi penting untuk memantau efek toksik. Efek samping akut meliputi mual, muntah, diare, alopesia, natrium rendah dan mielotoksisitas reversibel seperti penurunan leukosit darah dan trombosit, tetapi pemulihan biasanya dimulai setelah 2 minggu. Efek toksik yang umum dari penggunaan jangka panjang adalah: 1. Tumor ganas: ada korelasi dengan dosis total CTX, dan kemungkinan tumor yang terjadi di atas 30 g meningkat secara signifikan, sebagian besar tumor ganas pada saluran kemih, sumsum tulang, dan kulit; 2. Sistitis hemoragik: biasanya terjadi setelah pemberian CTX secara oral, dan kebanyakan orang tidak minum banyak air setelah minum obat. Beberapa orang percaya bahwa kemungkinan tumor kandung kemih meningkat secara signifikan setelah terjadinya sistitis hemoragik, sehingga disebut kerusakan pra-kanker; 3, toksisitas reproduksi: setelah penerapan CTX pada wanita, terutama setelah usia paruh baya, dapat menyebabkan kegagalan ovarium, dimanifestasikan sebagai amenore, kemandulan, dan pada wanita hamil, juga dapat muncul janin yang abnormal; dan pada pria, pembentukan atrofi testis, kehilangan libido, azoospermia atau kelemahan sperma; 4, infeksi. Karena CTX dapat menyebabkan penurunan imunitas tubuh, maka mudah terbentuk berbagai infeksi bakteri dan virus, terutama beberapa infeksi oportunistik. Seperti disebutkan di atas, CTX memiliki beberapa efek samping toksik yang serius, tetapi tidak boleh diabaikan begitu saja. Pengelolaan yang benar dari kontradiksi ini tergantung pada kontrol ketat terhadap indikasi dan pengamatan ketat terhadap berbagai efek toksik.