Bukti yang terkait dengan lesi penyakit defisiensi metabolik nutrisi seperti riwayat malnutrisi dengan defisiensi niasin vitamin B1 dan asam folat serta tanda dan gejala defisiensi metabolik nutrisi yang mengarah ke kelainan fungsional yang sesuai dapat digunakan sebagai kondisi diagnostik untuk gangguan mental yang terkait dengan penyakit metabolik nutrisi. Kekurangan vitamin B1 dikaitkan dengan berbagai gangguan neuropsikiatri, dan sindrom neuropsikiatri klasik yang parah yang disebabkannya adalah beri-beri dan ensefalopati Wernicke. Perubahan patologis terutama dari saluran air otak tengah hipotalamus tubuh papiler ke ventrikel keempat dan korteks serebelum dengan hipertrofi sel endotel perivaskular kiri dan kanan yang simetris, perdarahan sporadis, dan keterbelakangan mental; jika pembentukan retikuler terlibat, ada gangguan kesadaran; bila kekurangan vitamin B1 disertai dengan metabolisme glukosa yang terganggu, dapat terjadi oedema serebral. Gejala neurologis disebabkan oleh kekurangan vitamin B1 di otak dan edema kemacetan sumsum tulang belakang, degenerasi, dll. Perubahan di atas paling jelas terlihat pada saraf perifer, saraf tungkai saraf frenikus saraf kranial terminal dan cabang terminal saraf vagus juga lebih rentan terhadap keterlibatan, sering kali neuritis perifer gangguan gerakan mata nistagmus, ataksia, perdarahan retina sesekali, dll. Kasus-kasus serius di atas sekarang lebih jarang terjadi. Kekurangan niasin dengan gangguan mental juga dikenal sebagai pellagra atau pellagra. Ada banyak penyebab kekurangan niasin, seperti asupan makanan yang tidak memadai, alkoholisme kronis, dan diare kronis. Telah disarankan bahwa niasin adalah reseptor polimetil dan kekurangannya dapat menyebabkan peningkatan produk metilasi katekolamin yang mengakibatkan gangguan kejiwaan. Dalam beberapa tahun terakhir telah dilaporkan bahwa kekurangan asam folat dan vitamin B12 dapat memainkan peran utama dalam beberapa gangguan kejiwaan, dan peran asam folat telah ditunjukkan dalam depresi dan gangguan skizofrenia yang serupa. Kekurangan asam folat dapat dikaitkan dengan demensia pada pasien usia lanjut yang mengalami gangguan mental.