Skrining ultrasonografi janin untuk penyakit jantung dini saat ini direkomendasikan antara 20-23 minggu untuk kehamilan berisiko rendah dan antara 12-14 minggu untuk kehamilan berisiko tinggi. Ketika penghentian kehamilan merupakan suatu pilihan, semakin dini diagnosis dibuat, semakin baik bagi ibu dan semakin tidak menyakitkan. Namun, ukuran jantung janin yang kecil pada awal kehamilan membuat gambar USG kurang jelas dan akurat secara diagnostik, dan karena jantung janin merupakan proses perkembangan yang dinamis, beberapa kelainan jantung bawaan yang tidak terlihat sejak awal tetapi berkembang selama kehamilan tidak dapat dideteksi sejak dini. Karena alasan ini, ekokardiografi kehamilan dini hanya diindikasikan untuk janin berisiko tinggi dan sering diulang hingga 18-24 minggu untuk meningkatkan deteksi dan akurasi anomali jantung janin. Pada usia kehamilan 18 hingga 24 minggu, jantung janin secara bertahap menjadi lebih berkembang dan struktur intrakardiak terlihat jelas, janin lebih bergerak, volume cairan ketuban tinggi, dan ekokardiogram dapat menunjukkan hingga 100% dari berbagai pandangan. Pada tahap akhir kehamilan, janin berada dalam posisi yang relatif tetap dengan cairan ketuban yang lebih sedikit, dan janin sebagian besar berada pada posisi anterior oksipital, sehingga jendela transmisi suara buruk.