Tidak ada tes tunggal yang dapat mengkonfirmasi diagnosis penyakit radang usus, dan dokter sering kali perlu mengintegrasikan beberapa sumber informasi untuk membuat diagnosis. Selain riwayat dan pemeriksaan fisik, diagnosis penyakit radang usus biasanya memerlukan kombinasi kolonoskopi dan/atau mikroskop usus kecil, serta pencitraan usus kecil dengan makanan barium. Saat ini, di banyak pusat medis, pencitraan usus kecil barium meal telah digantikan oleh CTE. Langkah-langkah utama dalam CTE meliputi pelebaran oral usus kecil dengan sejumlah besar (setidaknya 1400 ml) kontras netral, kontras dinding usus dengan lumen usus, pemberian kontras yodium secara intravena, dan akuisisi gambar pemindaian tipis perut dan panggul. Fitur utama penyakit Crohn pada CTE adalah: peningkatan atau asimetris ketebalan dinding usus, peningkatan dinding usus yang ditandai, delaminasi dinding usus, hiperplasia fibrofatty, peningkatan kepadatan lemak mesenterika dan tanda-tanda seperti sisir. Telah disarankan bahwa CTE secara signifikan lebih sensitif terhadap peradangan usus kecil aktif daripada pencitraan usus kecil barium meal, terutama karena penyakit Crohn adalah lesi transmural dan tidak hanya terbatas pada mukosa usus, dan pencitraan barium meal tidak sepenuhnya mencerminkan penyakit. Presentasi pencitraan CTE sangat konsisten dengan aktivitas penyakit Crohn dan presentasi endoskopi lainnya, serta konsentrasi CRP serum. Sebuah studi prospektif tentang diagnosis penyakit Crohn menunjukkan bahwa CTE lebih sensitif dan lebih spesifik daripada ileoskopi dan pencitraan usus kecil barium meal untuk peradangan usus kecil yang aktif daripada endoskopi kapsul. Selain itu, CTE juga memiliki keuntungan yang signifikan untuk striktur usus kecil yang dapat menyebabkan emboli endoskopi kapsul. Kerugian CTE adalah: 1. Tidak cocok untuk semua pasien dengan penyakit Crohn. Tonus usus yang tidak mencukupi atau ketidakmampuan untuk mentoleransi kontras intravena (defisiensi ginjal, alergi kontras yang parah) membatasi penggunaan CTE dan pasien harus beralih ke tes lain. 2. CTE lebih mahal daripada makan barium usus kecil, tetapi ini jelas sepadan dengan biaya yang dikeluarkan sehubungan dengan informasi dan manfaat diagnostik akhir yang dapat diberikan oleh CTE. Satu studi menunjukkan bahwa CTE dapat mengubah penggunaan glukokortikoid pada lebih dari setengah pasien. 3. CTE menyebabkan peningkatan paparan radiasi bagi pasien. Pasien menerima radiasi tiga sampai empat kali lebih banyak selama CTE daripada selama makan barium usus kecil, tetapi masalah ini sekarang sedang diatasi dengan kemajuan teknologi CT; dan dengan peningkatan resolusi MRI, MRE (magnetic resonance enterography) semakin banyak digunakan dalam praktik klinis. CTE adalah kemajuan besar dalam pencitraan usus kecil dibandingkan dengan pencitraan usus kecil barium meal. Karena sensitivitasnya yang tinggi terhadap peradangan usus kecil aktif dan kemampuannya untuk mendeteksi komplikasi ekstraluminal dibandingkan dengan endoskopi kapsul, endoskopi ini telah menggantikan pencitraan usus kecil barium meal sebagai modalitas pencitraan lini pertama untuk penyakit usus kecil di banyak pusat.