Oligodendroglioma biasanya menunjukkan perubahan genetik spesifik yang membedakannya dari jenis glioma lainnya. Perubahan genetik yang paling umum pada oligodendroglioma adalah penghapusan heterozigot lengan panjang kromosom 19 (19q), yang terjadi pada 75-80% kasus, dengan daerah penghapusan yang umum pada 19q13.3; penghapusan heterozigot lengan pendek kromosom 1 (1p) juga sering terjadi pada 75-90% kasus. Insiden penghapusan gabungan 1p dan 19q adalah sekitar 60-70%. Penghapusan ini jarang terjadi pada jenis glioma lainnya, khususnya astrositoma. Faktor transkripsi oligodendrosit Olig1 dan Olig2 adalah gen keluarga oligodendrosit, yang diekspresikan tidak hanya pada sel dewasa tetapi juga pada prekursor oligodendrosit, dan diekspresikan secara spesifik. Glioblastoma.