Selain karsinoma hepatoseluler primer, terdapat juga tumor ganas lain pada hati seperti karsinoma hepatoseluler sekunder, sarkoma hati, hepatoblastoma, dan sistadenokarsinoma. Kanker hati sekunder adalah tumor ganas yang paling umum selain kanker hati primer. Tumor ganas pada saluran pencernaan, pankreas, paru-paru, payudara, tulang, prostat, dan organ lainnya dapat bermetastasis ke hati. Diagnosis bergantung pada USG dan CT untuk melihat beberapa tumor di hati, dan pasien cenderung memiliki riwayat pembedahan untuk tumor ganas pada organ lain atau tumor ganas yang terdeteksi saat pemeriksaan pada organ-organ ini. Hepatosarkoma adalah tumor ganas hati yang langka, yang merupakan tumor ganas yang berasal dari endotel pembuluh darah, otot polos, dan jaringan lain. Diagnosis bergantung pada USG dan CT yang menunjukkan adanya hipoekoik, atau hipodens, dengan alfa-fetoprotein negatif. Pengobatan didasarkan pada reseksi bedah. Hepatoblastoma adalah keganasan yang umum terjadi pada masa kanak-kanak, dengan sekitar 90% terjadi pada usia di bawah 5 tahun, dan lebih dari 90% positif alfa-fetoprotein, dengan kadar yang lebih tinggi daripada karsinoma hepatoseluler primer. Diagnosis dapat ditegakkan berdasarkan riwayat penyakit, pemeriksaan CT dan pemeriksaan lainnya. Pengobatannya terutama melalui pembedahan, dan kemoterapi juga dapat digunakan bagi mereka yang tidak dapat dioperasi. Sistadenokarsinoma adalah keganasan dari sistadenoma epitel saluran empedu intrahepatik, dengan alfa-fetoprotein negatif. Diagnosis terutama tergantung pada ruang kistik intrahepatik yang terlihat pada USG dan CT, dan perbedaan antara sistadenokarsinoma dan kista atau sistadenoma hepatik adalah bahwa sistadenokarsinoma memiliki dinding kista yang lebih tebal, dengan dinding bagian dalam yang tidak rata, tonjolan seperti papila, dan sering terjadi pemisahan di dalam kista. Reseksi bedah adalah pengobatan utama.