Waktu pengobatan penyakit hati autoimun tidak dapat disamaratakan, karena kondisi setiap pasien berbeda, akan ada perbedaan rencana pengobatan yang digunakan, periode pengobatan secara alami akan berbeda, dan beberapa kondisi pasien mungkin kambuh, sehingga waktu pengobatan yang diperlukan akan lebih lama, semakin serius kondisi pasien perlu diobati untuk jangka waktu yang umumnya relatif lebih lama. Penyakit hati autoimun adalah jenis penyakit hati yang disebabkan oleh kelainan pada sistem autoimun yang menyebabkan penurunan fungsi hati, dan dapat dibagi menjadi lima jenis yang berbeda: hepatitis autoimun, sirosis empedu primer, kolangitis sklerosis primer, sindrom tumpang tindih, dan kolangitis terkait Ig4. Setiap pasien dengan penyakit hati autoimun berbeda, sehingga tidak mungkin untuk secara akurat menentukan berapa lama pasien perlu diobati, misalnya, beberapa pasien dengan kolangitis terkait Ig4 telah dilaporkan mengalami remisi jangka panjang yang lengkap setelah tiga bulan pengobatan; sedangkan, pasien dengan hepatitis autoimun yang diobati dengan obat-obatan sangat mungkin gagal diobati atau memiliki kondisi respons yang tidak lengkap, atau bahkan mungkin gagal diobati. Kesimpulannya, banyak faktor yang dapat memengaruhi lamanya pengobatan untuk penyakit hati autoimun, tetapi terlepas dari kondisi individu, ia harus secara aktif bekerja sama dengan dokter untuk mematuhi pengobatan.