Asam ursodeoksikolat dapat dikonsumsi secara oral untuk beberapa penyakit hati autoimun, tetapi perlu memperhatikan deteksi fungsi hati, dan dianjurkan untuk menghentikan penggunaan obat tepat waktu jika ada reaksi yang merugikan. Terdapat tiga jenis utama penyakit hati autoimun, yaitu hepatitis autoimun, kolangitis bilier primer, dan kolangitis sklerosis primer. Kolangitis sklerosis primer dan kolangitis bilier primer dapat diobati dengan asam ursodeoksikolat. Namun, obat ini biasanya tidak digunakan secara rutin untuk hepatitis autoimun. Selama pengobatan, disarankan agar penanda fungsi hati seperti alanine aminotransferase (AST) dan alanine aminotransferase (ALT) diuji secara teratur. Jika terjadi reaksi merugikan yang serius seperti diare yang tidak dapat ditoleransi, disfungsi hepatobilier yang parah, urtikaria, dll., dianjurkan untuk menghentikan penggunaan obat dan segera mencari bantuan medis. Asam ursodeoksikolat merupakan kontraindikasi pada penyakit hati autoimun yang dikombinasikan dengan alergi obat, kolesistitis akut, obstruksi empedu, serangan kolik empedu yang sering terjadi, dan gangguan fungsi kandung empedu. Asam ursodeoksikolat harus digunakan di bawah pengawasan dokter.