Prognosis untuk sindrom hemofagositik adalah buruk, dengan perkembangan yang cepat dan mortalitas yang tinggi, tetapi beberapa pasien dapat mencapai hasil yang baik dengan pengobatan yang agresif, setelah terapi induksi + terapi pemeliharaan; dengan pengobatan yang agresif terhadap penyakit primer, beberapa pasien dapat mencapai hasil pengobatan kuratif.