Selama konsultasi, adalah hal yang umum untuk menemukan wanita hamil dengan hepatitis B yang menanyakan apakah mereka dapat menjalani amniosentesis untuk diagnosis prenatal. Tidak setiap kehamilan membutuhkan amniosentesis, amniosentesis terutama untuk pasien yang membutuhkan diagnosis prenatal, termasuk risiko tinggi sindrom Down, misalnya, wanita hamil berusia di atas 35 tahun, dari usia tersebut aspek tunggal ini telah mencapai indikator risiko tinggi sindrom Down 1/300, sehingga disarankan agar setiap wanita hamil yang berusia lanjut melakukan amniosentesis. Selain itu, setiap wanita hamil juga perlu melakukan skrining Sindrom Down pada saat pemeriksaan kehamilan, jika indikator tes yang dihasilkan lebih dari 1/250, maka juga termasuk dalam kategori risiko tinggi dan dianjurkan untuk melakukan diagnosis prenatal. Lalu ada diagnosis prenatal yang juga direkomendasikan untuk wanita yang pernah memiliki anak Down’s atau cacat sebelumnya dan hamil lagi. Jika janin ditemukan memiliki kelainan jantung yang parah, obstruksi usus, atau cairan saluran kemih pada pencitraan seperti USG selama kehamilan, diagnosis prenatal diperlukan untuk menyingkirkan kelainan kromosom. Jika kelainan ini tidak dikombinasikan dengan kelainan kromosom, maka anak akan lahir dengan kesempatan untuk operasi dan dapat diperbaiki melalui pembedahan. Namun, jika terdapat kombinasi kelainan kromosom, seperti sindrom Down, meskipun pembedahan dilakukan, kecerdasan anak dan masalah lainnya akan menjadi beban ekonomi bagi masyarakat dan keluarga. Pada kasus lain, seperti talasemia, yang merupakan penyakit genetik keluarga, di mana kedua pasangan adalah pembawa jenis yang sama, amniosentesis diperlukan untuk menentukan apakah anak tersebut adalah talasemia berat. Ada juga ibu yang memiliki Rh-negatif dan dicurigai bahwa anak tersebut mungkin mengalami hemolisis yang tidak sesuai dengan Rh dan amniosentesis diperlukan. Jika ada kecurigaan adanya infeksi intrauterin seperti pertumbuhan janin yang kecil, atau malformasi atipikal, perubahan seperti edema pada janin, dll., perlu dicari tahu apakah janin memiliki infeksi virus tertentu, dan perlu dilakukan diagnosis TORCH prenatal. Jika wanita hamil hanya pembawa virus Hepatitis B: hasil tes: hanya positif untuk antigen permukaan Hepatitis B, fungsi hati normal, salinan HBV-DNA kurang dari 3 kali 10, wanita hamil berusia 35 tahun atau lebih, atau kurang dari 35 tahun, tetapi hasil skrining prenatal berisiko tinggi, atau ultrasonografi menunjukkan bahwa perkembangan janin mungkin tidak normal, atau pernah ada kelahiran anak dengan kelainan bentuk atau anak dengan penyakit keturunan yang serius, atau salah satu dari pasangan tersebut memiliki kelainan kromosom. Atau jika salah satu dari pasangan memiliki kelainan kromosom, diagnosis prenatal amniosentesis mungkin dilakukan dan sangat diperlukan. Dalam kasus Hepatitis B, penting untuk melihat hasil tes penta Hepatitis B kuantitatif, terutama e-antigen, serta tes HBV-DNA kuantitatif dan tes fungsi hati. Pro dan kontra amniosentesis ditimbang berdasarkan risiko pasien memiliki anak yang cacat atau keterbelakangan mental. Dalam praktiknya, kemungkinan janin terinfeksi hepatitis B akibat amniosentesis sangat kecil. Hal ini dikarenakan jika seorang wanita hamil memiliki viral load Hepatitis B yang tinggi, janin mungkin sudah terinfeksi Hepatitis B sebelum amniosentesis dilakukan. Dokter di rumah sakit umum yang melakukan amniosentesis akan mengikuti prosedur aseptik yang ketat. Sebelum amniosentesis, perlu dilakukan tes untuk 4 penyakit menular (Hepatitis B, Hepatitis C, Sifilis dan HIV).