Tumor mesenkim saluran pencernaan memiliki latar belakang genetik tertentu, tetapi tidak berarti bahwa jika orang tua menderita tumor mesenkim saluran pencernaan, anaknya pasti akan terkena tumor mesenkim. Faktanya, tidak hanya tumor saluran mesenkim gastrointestinal, tetapi semua penyakit yang terkait secara genetik, seperti kanker perut dan usus, secara sederhana dikatakan memiliki kaitan genetik. Jika orang tua mengidap penyakit semacam itu, maka anak lebih mungkin mengidap penyakit tersebut daripada orang kebanyakan, tetapi tidak berarti bahwa anak akan mengidap penyakit tersebut. Hal ini juga bisa merupakan hasil dari kombinasi latar belakang genetik dan faktor yang diperoleh seperti gaya hidup. Latar belakang genetik tidak dapat diubah, tetapi tumor dapat dicegah melalui gaya hidup sehat dan pemeriksaan medis yang sering.