HLA adalah antigen yang ditemukan pada kromatin yang secara langsung berhubungan dengan genetika pada leukosit manusia dan dikodekan oleh lokus yang berbeda. Studi tahun 1973 oleh seorang sarjana Amerika dan Inggris menunjukkan bahwa ankylosing spondylitis berhubungan dengan HLA-locus. Mereka menemukan bahwa lebih dari 90% pasien dengan ankylosing spondylitis membawa HIA-B27; ada korelasi yang kuat antara HLA-B27 dan ankylosing spondylitis, tetapi menemukan HLA-B27 yang positif tidak mengkonfirmasi diagnosis ankylosing spondylitis. Hal ini karena hanya 20% orang yang HLA-B27 positif memiliki ankylosing spondylitis. Oleh karena itu, jelas tidak benar untuk mengasumsikan bahwa kepositifan HIA-B27 berarti Anda menderita ankylosing spondylitis. Perlu juga dicatat bahwa hampir 10% pasien dengan ankylosing spondylitis juga negatif untuk HIA-B27. Diagnosis ankylosing spondylitis tetap harus didasarkan pada gejala klinis dan perubahan pencitraan, dan HIA-B27 positif hanya boleh digunakan sebagai indikator referensi penting.