Empat subtipe virus Ebola telah diidentifikasi, yaitu Ebola-Zaire (EBO-Zaire), Ebola-Sudan (EBO-Sudan), Ebola-Leston (EBO-R), dan Ebola-Côte d’Ivoire (EBO-CI). ebola-Z dan EBO-S sangat patogenik dan mematikan pada manusia dan primata non-manusia; EBO R tidak patogenik pada manusia dan mematikan pada primata bukan manusia; EBO-CI jelas patogenik tetapi umumnya tidak mematikan pada manusia dan sangat mematikan pada simpanse. 1. Virus Ebola Zaire Virus Ebola Zaire memiliki tingkat kematian hingga 90%, dengan tingkat kematian di daerah endemis sebesar 88% pada tahun 1976, 100% pada tahun 1977, 59% pada tahun 1994, 81% pada tahun 1995, 73% pada tahun 1996, 80% dari tahun 2001 hingga 2002, 90% pada tahun 2003 dan rata-rata 83% pada tahun 2007. Wabah pertama tercatat pada tanggal 26 Agustus 1976 di kota utara Zaire, ketika seorang guru berusia 44 tahun, Mabalo Lokela, didiagnosa menderita demam yang dicurigai sebagai malaria dan diobati dengan suntikan kina, Pasien tersebut meninggal pada tanggal 18 September, setelah hanya sekitar dua minggu sakit. Tak lama setelah itu, lebih banyak pasien mencari pertolongan medis dengan gejala yang sama, termasuk demam, sakit kepala, nyeri otot, nyeri sendi, kelelahan, mual dan pusing. Penularan awal mungkin disebabkan oleh penggunaan kembali jarum suntik yang tidak disterilkan, sementara penularan selanjutnya terutama disebabkan oleh virus yang masuk ke dalam perawatan pasien tanpa tindakan pengamanan yang tepat atau proses pembersihan pada saat persiapan penguburan secara tradisional. 2. Virus Ebola Sudan Virus Ebola Sudan pertama kali diidentifikasi pada tahun 1976 pada seorang pekerja pabrik kapas Sudan. Para peneliti menduga bahwa pekerja tersebut telah terpapar oleh inang pembawa di dalam atau di dekat pabrik, tetapi setelah menguji hewan dan serangga di sekitar pabrik, tidak ada yang ditemukan dan inang pembawa masih belum diketahui. Kasus kedua adalah seorang pemilik klub malam yang tinggal di Sudan yang dirawat oleh rumah sakit setempat dengan segala upaya yang tersedia namun tidak berhasil dan akhirnya dinyatakan meninggal. Staf medis tidak melakukan tindakan pencegahan yang tepat saat merawatnya, sehingga mengakibatkan wabah besar virus menyebar ke seluruh rumah sakit. Wabah terakhir terjadi pada bulan Mei 2004, ketika 20 kasus dilaporkan di Kabupaten Yambio, Sudan, dan lima orang meninggal. Tingkat kematian rata-rata Ebola di Sudan adalah 53% pada tahun 1976, 68% pada tahun 1979 dan 53% antara tahun 2000 dan 2001, dengan tingkat kematian rata-rata 53,76%. 3. Reston Virus Ebola pertama kali terdeteksi pada bulan November 1989 pada sekelompok monyet pemakan kepiting yang diimpor dari Filipina ke Reston, Virginia, Amerika Serikat. Virus ini sangat mematikan bagi monyet, tetapi tidak bagi manusia. Pada bulan Februari 1990, terjadi lagi wabah Reston Ebola di Reston, Texas dan Filipina, dan pada tahun 1992 dan 1996, lebih banyak kasus ditemukan di Tuscany, Italia, dan Texas. Semua monyet yang terinfeksi hanya menunjukkan gejala yang mirip dengan gejala demam berdarah. Tidak ada manusia yang terinfeksi dalam kedua wabah ini. 4. Virus Ebola di Pantai Gading Spesies virus Ebola di Pantai Gading pertama kali diidentifikasi di Taman Nasional Taï di Pantai Gading. Pada tanggal 1 November 1994, mayat dua simpanse ditemukan di hutan. Para pemeriksa menemukan bahwa darah di jantung berwarna coklat dan mencair (darah dalam bangkai biasanya akan menggumpal sempurna setelah 10 jam atau lebih setelah kematian), tidak ada tanda-tanda organ dalam yang terlihat, dan paru-parunya penuh dengan darah. Jaringan yang diambil dari simpanse menunjukkan bahwa virus tersebut sangat mirip dengan Ebola Sudan dan wabah Ebola di Zaire tahun 1976. Setelah tahun 1994, lebih banyak simpanse mati ditemukan dan para ilmuwan menguji virus tersebut dengan berbagai metode. Sumber infeksi diduga berasal dari monyet colobus yang telah dimangsa simpanse dan membawa virus. Salah satu ilmuwan yang melakukan pemeriksaan post-mortem terinfeksi virus tersebut. Dia mengalami gejala mirip demam berdarah dan dibawa ke Swiss seminggu kemudian untuk menjalani perawatan. Dia keluar dari rumah sakit dua minggu kemudian dan sembuh total pada minggu keenam setelah tertular virus.