Peningkatan ALT merupakan indikasi pertama penyakit hati, tetapi jenis penyakit hati yang tepat perlu diklarifikasi. Dalam beberapa kasus, penyebab penyakit hati mudah dideteksi, seperti infeksi virus dan cedera hati akibat alkohol, yang sering kali dapat diklarifikasi dengan mengambil riwayat medis dan melakukan tes rutin. Penyakit hati lainnya lebih sulit didiagnosis, seperti penyakit hati autoimun dan penyakit hati metabolik, dan sering kali memerlukan biopsi tusukan hati serta tes khusus untuk memastikan diagnosis. Dengan meluasnya penggunaan obat antivirus dan vaksin hepatitis B, peningkatan transaminase hati yang disebabkan oleh hepatitis B menurun, sementara penyakit hati lainnya, seperti perlemakan hati yang disebabkan oleh alkohol atau faktor metabolik, dan penyakit hati autoimun meningkat. Diagnosis etiologi juga merupakan bagian penting dari diagnosis, karena hanya dengan mengobati penyebab penyakit, kita dapat benar-benar menjaga kesehatan dalam jangka panjang.