Indikasi untuk pembedahan batu saluran empedu tergantung pada apakah batu tersebut adalah batu saluran empedu ekstrahepatik atau intrahepatik, karena sebagian besar batu saluran empedu ekstrahepatik memerlukan pembedahan, sedangkan batu saluran empedu intrahepatik biasanya dapat dipantau. Batu saluran empedu ekstrahepatik biasanya diindikasikan untuk pembedahan, karena batu ini terletak di saluran empedu umum, dan jika batu ini menyebabkan obstruksi, batu ini akan mencegah drainase empedu dan menyebabkan gejala yang parah. Untuk batu saluran empedu ekstrahepatik dengan indikasi yang sesuai, ERCP dapat dipertimbangkan; untuk batu yang lebih besar dan lebih serius, di mana ERCP terbatas, ekstraksi bedah dapat dipertimbangkan. Untuk kasus tanpa gejala, pembedahan elektif dapat dipertimbangkan, sementara untuk kasus yang tidak terlalu bergejala, tetapi dengan batu yang lebih besar atau lebih banyak, atau dalam kasus kolangitis akut atau bahkan kolangitis supuratif obstruktif akut yang lebih parah, diperlukan pembedahan darurat segera dengan sayatan, drainase dan ekstraksi batu. Batu saluran empedu intrahepatik: Jika jumlah batunya sedikit dan tidak menyebabkan gejala serius, biasanya batu-batu ini dapat diamati terlebih dahulu. Batu saluran empedu intrahepatik diindikasikan untuk episode inflamasi berulang dari saluran empedu intrahepatik, atau untuk penyempitan atrofi saluran empedu, dilatasi saluran empedu jauh, atau kolangitis berulang atau infeksi saluran empedu yang menyebabkan atrofi atau fibrosis jaringan hati terlokalisasi, atau di mana risiko kanker akibat batu tidak dapat dikecualikan, atau di mana ada kombinasi obstruksi batu saluran empedu umum. Dalam kasus ini, batu saluran empedu intrahepatik perlu dipertimbangkan untuk penanganan bedah lebih lanjut. Kesimpulannya, kebutuhan untuk mempertimbangkan pembedahan untuk batu saluran empedu akan tergantung pada masing-masing kasus. Indikasi untuk pembedahan hanyalah arah awal yang harus diambil, karena lokasi, ukuran, dan jumlah batu spesifik setiap orang, serta ada atau tidaknya komplikasi serius yang menyertai, berbeda-beda. Secara teoritis, pasien harus menjalani pembedahan untuk menghilangkan batu, drainase, pengendalian infeksi dan menghilangkan penyempitan.