Sebagian besar rhabdomyosarcomas embryonal sangat sensitif terhadap radioterapi dan dapat diobati dengan radioterapi dalam waktu 1 minggu setelah pembedahan bagi mereka yang menjalani reseksi bedah. Untuk anak-anak dengan invasi dasar tengkorak yang signifikan yang memerlukan radioterapi segera, radioterapi dapat diberikan sebelum kemoterapi. Jika tumor terlalu besar untuk pembedahan, dianjurkan untuk melakukan radioterapi. Radioterapi partikel dapat dipertimbangkan jika tumor primer terletak di organ vital yang tidak dapat diangkat melalui pembedahan. Embryonal rhabdomyosarcoma memerlukan kombinasi pilihan pengobatan seperti pembedahan, radioterapi dan kemoterapi. Radioterapi adalah bagian yang sangat penting dari pengobatan, termasuk radioterapi eksternal dan implantasi partikel. Pedoman saat ini merekomendasikan tidak ada radioterapi untuk rhabdomyosarcoma embrional stadium I dan radioterapi untuk rhabdomyosarcoma embrional stadium II-IV. Adenoid rhabdomyosarcoma memiliki kekambuhan lokal, sehingga radioterapi diperlukan untuk semua stadium I-IV.