Penyakit refluks gastro-esofagus dan hernia hiatus esofagus adalah dua kondisi yang saling mengikuti seperti bayangan. Refluks gastro-esofagus adalah konsep fungsional yang mengacu pada refluks isi lambung ke dalam esofagus, yang kemudian mencapai tenggorokan dan saluran napas, menyebabkan berbagai gejala dan komplikasi; hernia hiatus esofagus adalah perubahan anatomi yang terjadi pada kardia. Hernia hiatus terjadi apabila bagian bawah lambung dan esofagus menonjol ke dalam rongga dada. Hernia hiatus tidak dapat dilihat melalui tubuh dan memerlukan gastroskopi atau pencitraan. Banyak pasien dengan hernia hiatus memiliki kombinasi gejala refluks, sehingga sangat erat kaitannya dengan GERD. Tentu saja, pada beberapa pasien dengan hernia hiatus tetapi tidak ada gejala refluks, hernia hiatus dapat diamati dan tidak perlu diobati. Jika refluks kronis telah berkembang, hernia hiatus perlu diobati. Jadi ada persilangan antara konsep anatomi dan konsep fungsional.